MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 11419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	TG	3	6	1437	1442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015949	TTA	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015949	TGG	2	6	1592	1597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015949	A	6	6	1621	1626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015949	GAA	2	6	1632	1637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015949	T	7	7	2750	2756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015949	ATT	2	6	4155	4160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015949	GGT	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015949	TGAT	2	8	6293	6300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015949	TGA	2	6	6303	6308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015949	AGG	2	6	6318	6323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015949	GAA	2	6	8792	8797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015949	A	6	6	8867	8872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015949	TAAG	2	8	8885	8892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015949	T	6	6	8925	8930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015949	TA	3	6	8946	8951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015949	TGA	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015949	ATT	2	6	9037	9042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015949	TCTTT	2	10	9070	9079	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015949	TATTCC	2	12	9111	9122	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015949	TTCT	2	8	9123	9130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015949	CTTAA	2	10	9134	9143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015949	TCT	2	6	9170	9175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015949	ATT	2	6	9202	9207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015949	A	7	7	9209	9215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015949	TC	3	6	9222	9227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015949	T	6	6	9238	9243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015949	AAC	2	6	9288	9293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015949	GATA	2	8	9370	9377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015949	AGA	2	6	9442	9447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015949	A	6	6	9555	9560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015949	ATT	2	6	9569	9574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015949	AT	3	6	9582	9587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015949	AG	3	6	9592	9597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015949	GAT	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015949	AAAT	2	8	9800	9807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015949	A	6	6	9814	9819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015949	GAA	2	6	9880	9885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015949	AAGGA	2	10	9912	9921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015949	GA	3	6	9942	9947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015949	A	6	6	9972	9977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015949	AAGT	2	8	10031	10038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015949	TCT	2	6	10110	10115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015949	GAA	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015949	AG	3	6	10196	10201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015949	A	6	6	10210	10215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015949	A	8	8	10227	10234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015949	GTA	2	6	10322	10327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015949	ATA	2	6	10328	10333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015949	AACT	2	8	10362	10369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015949	GAAA	2	8	10391	10398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015949	TAT	2	6	10404	10409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015949	AGT	2	6	10438	10443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015949	TTA	2	6	10448	10453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015949	AG	3	6	11296	11301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015949	GAGT	2	8	12615	12622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015949	ATT	2	6	12653	12658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015949	TGA	2	6	12687	12692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015949	ATA	2	6	12695	12700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015949	AC	3	6	12711	12716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015949	AAG	2	6	12748	12753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015949	ACA	2	6	12793	12798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015949	CAG	2	6	12816	12821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015949	TTTAA	2	10	12822	12831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015949	TA	3	6	12872	12877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015949	AAG	2	6	12916	12921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015949	TCA	2	6	12953	12958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015949	TGG	2	6	12977	12982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015949	GCA	3	9	12983	12991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015949	TTGCAA	2	12	12997	13008	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015949	CCA	2	6	13026	13031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015949	TGA	2	6	13043	13048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015949	AAC	2	6	13101	13106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015949	TTG	2	6	13200	13205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015949	T	7	7	13228	13234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015949	GAA	2	6	13266	13271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015949	AG	3	6	16481	16486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015949	GGC	2	6	16487	16492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015949	TGA	2	6	16586	16591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015949	GACAAA	2	12	16592	16603	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015949	TCT	3	9	16811	16819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015949	A	6	6	16900	16905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015949	A	6	6	17030	17035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015949	AGA	2	6	17049	17054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015949	TATG	2	8	17084	17091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015949	A	8	8	17166	17173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015949	GTT	2	6	17192	17197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015949	AATACC	2	12	17204	17215	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015949	ATT	2	6	17245	17250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015949	A	6	6	17361	17366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015949	T	6	6	17388	17393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015949	AAT	2	6	17394	17399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015949	TAC	2	6	17446	17451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015949	GAG	2	6	17458	17463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015949	T	6	6	17475	17480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015949	T	7	7	17542	17548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015949	AGG	2	6	17550	17555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015949	TGC	2	6	23593	23598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015949	A	6	6	23627	23632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015949	A	6	6	23639	23644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015949	AG	3	6	23646	23651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015949	A	6	6	23672	23677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015949	ATG	2	6	23694	23699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015949	A	6	6	24356	24361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015949	TTC	2	6	24366	24371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015949	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015949	TAT	2	6	24415	24420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015949	GGA	2	6	24479	24484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015949	AGC	2	6	29875	29880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015949	GCT	2	6	29917	29922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015949	CATT	2	8	29923	29930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015949	A	6	6	29944	29949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015949	A	7	7	30037	30043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015949	GTT	2	6	30055	30060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015949	GAG	2	6	30110	30115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015949	ACAGAA	2	12	30116	30127	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015949	A	6	6	30159	30164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015949	TTC	2	6	30182	30187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015949	A	7	7	30234	30240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015949	AT	3	6	30257	30262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015949	ATA	3	9	30271	30279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015949	GTAA	2	8	30293	30300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015949	T	6	6	30372	30377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015949	TAAA	2	8	30386	30393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015949	AGA	2	6	30396	30401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015949	A	6	6	30401	30406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015949	ATT	2	6	30413	30418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015949	GAGGT	2	10	30427	30436	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015949	A	6	6	30463	30468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015949	AAT	2	6	30485	30490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015949	AGG	2	6	30499	30504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015949	ATA	2	6	33533	33538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015949	AT	3	6	33556	33561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015949	ATTT	2	8	33600	33607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015949	T	6	6	33644	33649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015949	TTAA	2	8	33660	33667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015949	ATC	2	6	34904	34909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015949	AAG	2	6	36840	36845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015949	AT	3	6	36927	36932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015949	GCA	2	6	38543	38548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015949	AT	4	8	38750	38757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015949	TA	3	6	38804	38809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015949	AGA	2	6	38820	38825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015949	GAAC	2	8	40153	40160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015949	GCA	2	6	40182	40187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015949	GGT	2	6	40212	40217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015949	A	7	7	40367	40373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015949	CTT	2	6	40387	40392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015949	ATA	2	6	40406	40411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015949	T	6	6	43288	43293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015949	T	7	7	50255	50261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015949	AT	3	6	98419	98424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_015949	TTA	2	6	131370	131375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_015949	AAT	2	6	134092	134097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_015949	CAA	2	6	137310	137315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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